6月6日,应农学院邀请,俄亥俄州立大学区树俊教授来校,为农学院、动物科学与医学学院师生作学术报告,题为“Towards the high-quality, de novo annotation of transposable elements in eukaryotes”。
区树俊教授在报告中详细介绍了他开发的注释转座子 (Transposable element, TE)的软件工具EDTA2,并利用水稻、玉米和果蝇基因组对EDTA进行评测,横向比较了软件对不同物种的支持。他重点讲解了在EDTA2版本中,对SINE和LINE类型的转座子检测中得到质的飞跃,同时还增加了构建PanTE的功能,可以为物种进化提供新的见解。区树俊教授还就转座子在农作物和牲畜科研育种中的应用与师生进行讨论。
区树俊教授长期致力于研究转座子的进化及其活动对生物功能(抗逆、环境适应以及物种形成)的贡献,开发的一系列广泛使用的TE注释和分析工具,推动了高质量基因组时代转座子研究的革新。在Nature,Science,Cell,Nature Genetics,Nature Communications,Genome Biology等权威期刊上发表高水平研究论文近50篇,被引7300余次。(农学院 薛伟)