近日,由我校动物科学与医学学院畜禽遗传育种团队牵头,联合辽宁省农业发展服务中心、辽宁绒山羊原种场等单位共同攻关的“绒山羊T2T泛基因组55K液相育种芯片”研制成功,国内首款基于双T2T泛基因组的绒山羊育种芯片——“中绒一号”正式问世。这标志着我国绒山羊分子育种核心工具实现自主可控。
长期以来,绒山羊育种依赖传统固相芯片和单一参考基因组,本土品种特有遗传变异难以全面覆盖。我校科研团队创新构建了辽宁绒山羊、内蒙古绒山羊等七个品种联合泛基因组,以两套完整T2T基因组为骨架,整合SNP、InDel、SV、CNV等多类型变异信息,从底层突破单一参考基因组带来的变异盲区短板。
“中绒一号”搭载55000个高质量遗传标记,包含12000个经GWAS验证的产绒、生长、繁殖、抗逆等主效功能位点,分型检出率≥95%,基因型填充精度超98%。区别于传统固相芯片,该液相芯片具备探针可迭代、微量DNA可检测、成本低、周期短等优势,可实现羔羊早期基因组选种,育种周期缩短40%以上。芯片可支撑遗传多样性分析、血统溯源、近交控制等种质保护工作,适配全基因组选择育种模型,服务绒、肉、乳、抗逆多性状基因聚合及分子设计育种,跨品种适配国内四大绒山羊及肉、奶山羊育种工作。
学校畜禽遗传育种团队持续聚焦畜禽种业“卡脖子”技术难题,深耕畜禽遗传育种与种质资源创新领域。团队将持续开展位点迭代与示范应用,挖掘经济性状关键基因,以基因组育种技术助力畜禽种业自立自强。(动物科学与医学学院 王天奇 王泽英)